Нет. Это не так. Для предметов под водой используются совершенно другие спрайты + плавающие черви(уж на них точно воду не наложишь).
Я пытался вместо спайта обычной овцы впехнуть клон овцу, но когда она попадает в воду, то там тонет обычная овца.
Вопрос остается в силе) Еще наверное в отдельном файле хранятся спрайты с зараженными червями(когда они держат оружие), хотя тут уже более вероятно что тут накладывается цвет.